Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD53P19397 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD53P19397 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD53P19397 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD53P19397 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD53P19397 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD53P19397 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD53P19397 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD53P19397 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD53P19397 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD53P19397 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD53P19397 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD53P19397 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD53P19397 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD53P19397 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD53P19397 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD53P19397 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD53P19397 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD53P19397 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD53P19397 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD53P19397 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD53P19397 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD53P19397 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD53P19397 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD53P19397 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD53P19397 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD53P19397 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD53P19397 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD53P19397 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD53P19397 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD53P19397 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD53P19397 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD53P19397 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD53P19397 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD53P19397 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD53P19397 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD53P19397 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD53P19397 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD53P19397 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD53P19397 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD53P19397 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD53P19397 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD53P19397 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD53P19397 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD53P19397 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD53P19397 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD53P19397 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD53P19397 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD53P19397 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD53P19397 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD53P19397 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD53P19397 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD53P19397 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD53P19397 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD53P19397 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD53P19397 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD53P19397 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD53P19397 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD53P19397 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD53P19397 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD53P19397 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD53P19397 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD53P19397 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD53P19397 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD53P19397 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD53P19397 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD53P19397 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD53P19397 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD53P19397 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD53P19397 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD53P19397 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD53P19397 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD53P19397 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD53P19397 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD53P19397 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD53P19397 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD53P19397 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD53P19397 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD53P19397 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD53P19397 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD53P19397 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD53P19397 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD53P19397 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD53P19397 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD53P19397 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD53P19397 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms