Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA1P17302 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA1P17302 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA1P17302 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA1P17302 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA1P17302 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA1P17302 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA1P17302 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA1P17302 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA1P17302 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA1P17302 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA1P17302 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA1P17302 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA1P17302 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA1P17302 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA1P17302 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA1P17302 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA1P17302 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA1P17302 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA1P17302 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA1P17302 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA1P17302 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJA1P17302 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA1P17302 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA1P17302 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA1P17302 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA1P17302 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA1P17302 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA1P17302 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA1P17302 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA1P17302 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA1P17302 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA1P17302 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA1P17302 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA1P17302 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA1P17302 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA1P17302 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA1P17302 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA1P17302 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA1P17302 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA1P17302 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA1P17302 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA1P17302 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA1P17302 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA1P17302 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA1P17302 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA1P17302 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA1P17302 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA1P17302 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA1P17302 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA1P17302 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA1P17302 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA1P17302 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA1P17302 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA1P17302 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA1P17302 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA1P17302 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA1P17302 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA1P17302 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA1P17302 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA1P17302 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA1P17302 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA1P17302 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA1P17302 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA1P17302 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA1P17302 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA1P17302 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA1P17302 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA1P17302 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA1P17302 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA1P17302 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA1P17302 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA1P17302 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA1P17302 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA1P17302 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA1P17302 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA1P17302 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms