Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLS3P13797 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS3P13797 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS3P13797 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS3P13797 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLS3P13797 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS3P13797 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS3P13797 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS3P13797 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS3P13797 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS3P13797 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLS3P13797 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PLS3P13797 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS3P13797 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS3P13797 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS3P13797 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS3P13797 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS3P13797 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLS3P13797 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS3P13797 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLS3P13797 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS3P13797 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS3P13797 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS3P13797 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS3P13797 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLS3P13797 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS3P13797 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS3P13797 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS3P13797 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLS3P13797 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLS3P13797 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLS3P13797 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLS3P13797 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLS3P13797 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLS3P13797 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLS3P13797 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLS3P13797 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS3P13797 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS3P13797 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS3P13797 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS3P13797 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS3P13797 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLS3P13797 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS3P13797 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS3P13797 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS3P13797 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS3P13797 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS3P13797 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLS3P13797 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLS3P13797 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLS3P13797 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLS3P13797 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLS3P13797 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLS3P13797 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLS3P13797 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLS3P13797 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLS3P13797 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLS3P13797 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLS3P13797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLS3P13797 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLS3P13797 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLS3P13797 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLS3P13797 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLS3P13797 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLS3P13797 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PLS3P13797 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLS3P13797 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLS3P13797 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLS3P13797 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PLS3P13797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLS3P13797 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLS3P13797 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLS3P13797 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLS3P13797 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLS3P13797 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PLS3P13797 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLS3P13797 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLS3P13797 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PLS3P13797 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLS3P13797 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLS3P13797 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLS3P13797 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PLS3P13797 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLS3P13797 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLS3P13797 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLS3P13797 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLS3P13797 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLS3P13797 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLS3P13797 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLS3P13797 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLS3P13797 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLS3P13797 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms