Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
RLBP1P12271 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RLBP1P12271 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RLBP1P12271 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RLBP1P12271 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms