Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL11A1P12107 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL11A1P12107 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL11A1P12107 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms