Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM10L2AP0DMW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM10L2AP0DMW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMIM10L2AP0DMW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM10L2AP0DMW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms