Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPBGLP0DKB5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPBGLP0DKB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPBGLP0DKB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms