Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGA3P0DJD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGA3P0DJD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGA3P0DJD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms