Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KRTAP1-4P0C5Y4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP1-4P0C5Y4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms