Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLK3P07288 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLK3P07288 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLK3P07288 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLK3P07288 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLK3P07288 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLK3P07288 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLK3P07288 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLK3P07288 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLK3P07288 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLK3P07288 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLK3P07288 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLK3P07288 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLK3P07288 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLK3P07288 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLK3P07288 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLK3P07288 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLK3P07288 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLK3P07288 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLK3P07288 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLK3P07288 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLK3P07288 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLK3P07288 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLK3P07288 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLK3P07288 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLK3P07288 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLK3P07288 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLK3P07288 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLK3P07288 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLK3P07288 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLK3P07288 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLK3P07288 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLK3P07288 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLK3P07288 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLK3P07288 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLK3P07288 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLK3P07288 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLK3P07288 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLK3P07288 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLK3P07288 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLK3P07288 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLK3P07288 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLK3P07288 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLK3P07288 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLK3P07288 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLK3P07288 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLK3P07288 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLK3P07288 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLK3P07288 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLK3P07288 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLK3P07288 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLK3P07288 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLK3P07288 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLK3P07288 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLK3P07288 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLK3P07288 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLK3P07288 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLK3P07288 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLK3P07288 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLK3P07288 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLK3P07288 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLK3P07288 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLK3P07288 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLK3P07288 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLK3P07288 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLK3P07288 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLK3P07288 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLK3P07288 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms