Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQB2P05538 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQB2P05538 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQB2P05538 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQB2P05538 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQB2P05538 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQB2P05538 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQB2P05538 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DQB2P05538 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DQB2P05538 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms