Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDN1P05305 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDN1P05305 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EDN1P05305 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EDN1P05305 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EDN1P05305 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EDN1P05305 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EDN1P05305 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EDN1P05305 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDN1P05305 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDN1P05305 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EDN1P05305 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDN1P05305 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDN1P05305 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDN1P05305 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDN1P05305 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EDN1P05305 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDN1P05305 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDN1P05305 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDN1P05305 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDN1P05305 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDN1P05305 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDN1P05305 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDN1P05305 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EDN1P05305 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDN1P05305 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EDN1P05305 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDN1P05305 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDN1P05305 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDN1P05305 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDN1P05305 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDN1P05305 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDN1P05305 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDN1P05305 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDN1P05305 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDN1P05305 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EDN1P05305 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDN1P05305 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDN1P05305 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDN1P05305 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDN1P05305 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDN1P05305 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDN1P05305 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDN1P05305 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EDN1P05305 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDN1P05305 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDN1P05305 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDN1P05305 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDN1P05305 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDN1P05305 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EDN1P05305 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDN1P05305 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDN1P05305 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDN1P05305 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EDN1P05305 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDN1P05305 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDN1P05305 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDN1P05305 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDN1P05305 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDN1P05305 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EDN1P05305 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDN1P05305 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDN1P05305 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EDN1P05305 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDN1P05305 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EDN1P05305 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDN1P05305 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EDN1P05305 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDN1P05305 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDN1P05305 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDN1P05305 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDN1P05305 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDN1P05305 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDN1P05305 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDN1P05305 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDN1P05305 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDN1P05305 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDN1P05305 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDN1P05305 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDN1P05305 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDN1P05305 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDN1P05305 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EDN1P05305 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDN1P05305 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDN1P05305 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDN1P05305 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDN1P05305 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EDN1P05305 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDN1P05305 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EDN1P05305 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDN1P05305 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDN1P05305 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDN1P05305 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDN1P05305 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EDN1P05305 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDN1P05305 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDN1P05305 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDN1P05305 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDN1P05305 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EDN1P05305 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms