Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ESR1P03372 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESR1P03372 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESR1P03372 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESR1P03372 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESR1P03372 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ESR1P03372 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ESR1P03372 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ESR1P03372 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ESR1P03372 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ESR1P03372 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESR1P03372 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESR1P03372 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESR1P03372 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESR1P03372 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESR1P03372 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESR1P03372 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ESR1P03372 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESR1P03372 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESR1P03372 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESR1P03372 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESR1P03372 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ESR1P03372 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESR1P03372 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESR1P03372 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESR1P03372 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESR1P03372 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ESR1P03372 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESR1P03372 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ESR1P03372 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESR1P03372 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ESR1P03372 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ESR1P03372 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESR1P03372 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESR1P03372 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESR1P03372 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESR1P03372 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ESR1P03372 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ESR1P03372 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ESR1P03372 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ESR1P03372 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ESR1P03372 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ESR1P03372 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ESR1P03372 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ESR1P03372 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ESR1P03372 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ESR1P03372 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ESR1P03372 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ESR1P03372 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ESR1P03372 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ESR1P03372 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ESR1P03372 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESR1P03372 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESR1P03372 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ESR1P03372 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESR1P03372 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ESR1P03372 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESR1P03372 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESR1P03372 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESR1P03372 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ESR1P03372 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESR1P03372 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESR1P03372 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ESR1P03372 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESR1P03372 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESR1P03372 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESR1P03372 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESR1P03372 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESR1P03372 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESR1P03372 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ESR1P03372 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ESR1P03372 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ESR1P03372 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ESR1P03372 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ESR1P03372 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms