Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV3-15P01624 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV3-15P01624 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms