Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAPLNO95428 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPLNO95428 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAPLNO95428 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPLNO95428 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms