Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SVILO95425 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SVILO95425 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVILO95425 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SVILO95425 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SVILO95425 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVILO95425 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVILO95425 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVILO95425 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SVILO95425 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVILO95425 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVILO95425 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SVILO95425 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SVILO95425 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SVILO95425 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SVILO95425 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SVILO95425 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVILO95425 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVILO95425 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVILO95425 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVILO95425 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVILO95425 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVILO95425 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVILO95425 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SVILO95425 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SVILO95425 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SVILO95425 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVILO95425 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVILO95425 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVILO95425 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVILO95425 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVILO95425 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVILO95425 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVILO95425 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVILO95425 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SVILO95425 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVILO95425 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVILO95425 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVILO95425 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVILO95425 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVILO95425 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVILO95425 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVILO95425 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVILO95425 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVILO95425 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVILO95425 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVILO95425 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SVILO95425 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVILO95425 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVILO95425 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SVILO95425 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVILO95425 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVILO95425 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVILO95425 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVILO95425 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVILO95425 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVILO95425 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVILO95425 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVILO95425 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVILO95425 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVILO95425 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVILO95425 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVILO95425 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVILO95425 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVILO95425 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVILO95425 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVILO95425 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVILO95425 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVILO95425 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SVILO95425 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms