Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAPGEF3O95398 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RAPGEF3O95398 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAPGEF3O95398 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAPGEF3O95398 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAPGEF3O95398 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAPGEF3O95398 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms