Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCB11O95342 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCB11O95342 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB11O95342 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB11O95342 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms