Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE4BO95155 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4BO95155 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE4BO95155 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4BO95155 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4BO95155 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE4BO95155 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms