Protein–RNA interactions for Protein: O75969

AKAP3, A-kinase anchor protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP3O75969 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AKAP3O75969 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AKAP3O75969 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AKAP3O75969 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP3O75969 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms