Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMUO75648 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMUO75648 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMUO75648 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMUO75648 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMUO75648 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMUO75648 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMUO75648 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMUO75648 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMUO75648 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRMUO75648 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRMUO75648 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMUO75648 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMUO75648 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMUO75648 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMUO75648 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMUO75648 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMUO75648 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMUO75648 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMUO75648 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMUO75648 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMUO75648 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRMUO75648 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRMUO75648 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMUO75648 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMUO75648 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMUO75648 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMUO75648 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMUO75648 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMUO75648 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMUO75648 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMUO75648 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMUO75648 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMUO75648 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMUO75648 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMUO75648 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMUO75648 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMUO75648 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMUO75648 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMUO75648 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMUO75648 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMUO75648 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMUO75648 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMUO75648 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms