Protein–RNA interactions for Protein: O75333

TBX10, T-box transcription factor TBX10, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX10O75333 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TBX10O75333 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TBX10O75333 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBX10O75333 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBX10O75333 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBX10O75333 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBX10O75333 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TBX10O75333 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TBX10O75333 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TBX10O75333 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TBX10O75333 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TBX10O75333 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TBX10O75333 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TBX10O75333 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TBX10O75333 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TBX10O75333 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX10O75333 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX10O75333 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX10O75333 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TBX10O75333 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX10O75333 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX10O75333 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX10O75333 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX10O75333 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX10O75333 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TBX10O75333 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TBX10O75333 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TBX10O75333 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TBX10O75333 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX10O75333 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX10O75333 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX10O75333 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TBX10O75333 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TBX10O75333 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TBX10O75333 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TBX10O75333 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TBX10O75333 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX10O75333 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX10O75333 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX10O75333 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX10O75333 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TBX10O75333 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBX10O75333 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBX10O75333 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBX10O75333 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX10O75333 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX10O75333 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX10O75333 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX10O75333 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TBX10O75333 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBX10O75333 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBX10O75333 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBX10O75333 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TBX10O75333 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TBX10O75333 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX10O75333 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX10O75333 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX10O75333 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX10O75333 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBX10O75333 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX10O75333 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TBX10O75333 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms