Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED4O75132 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED4O75132 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZBED4O75132 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED4O75132 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms