Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNND1O60716 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNND1O60716 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTNND1O60716 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTNND1O60716 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND1O60716 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CTNND1O60716 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms