Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSPNO60542 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSPNO60542 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSPNO60542 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSPNO60542 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSPNO60542 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSPNO60542 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSPNO60542 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSPNO60542 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSPNO60542 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSPNO60542 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSPNO60542 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSPNO60542 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSPNO60542 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSPNO60542 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSPNO60542 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSPNO60542 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSPNO60542 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSPNO60542 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSPNO60542 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSPNO60542 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSPNO60542 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSPNO60542 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSPNO60542 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSPNO60542 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSPNO60542 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSPNO60542 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSPNO60542 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSPNO60542 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSPNO60542 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSPNO60542 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSPNO60542 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSPNO60542 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSPNO60542 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSPNO60542 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSPNO60542 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSPNO60542 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSPNO60542 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSPNO60542 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSPNO60542 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSPNO60542 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSPNO60542 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSPNO60542 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSPNO60542 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSPNO60542 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSPNO60542 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSPNO60542 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSPNO60542 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSPNO60542 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSPNO60542 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSPNO60542 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSPNO60542 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSPNO60542 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSPNO60542 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms