Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH7O60245 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH7O60245 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH7O60245 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms