Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EXTL3O43909 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXTL3O43909 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EXTL3O43909 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EXTL3O43909 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms