Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYNGR1O43759 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR1O43759 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR1O43759 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms