Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
HTATSF1O43719 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HTATSF1O43719 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HTATSF1O43719 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HTATSF1O43719 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
HTATSF1O43719 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms