Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN6O43657 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN6O43657 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSPAN6O43657 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN6O43657 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms