Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP2AO43633 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP2AO43633 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP2AO43633 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP2AO43633 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP2AO43633 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHMP2AO43633 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP2AO43633 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP2AO43633 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP2AO43633 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP2AO43633 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP2AO43633 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP2AO43633 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP2AO43633 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP2AO43633 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP2AO43633 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP2AO43633 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP2AO43633 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP2AO43633 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP2AO43633 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHMP2AO43633 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMP2AO43633 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP2AO43633 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP2AO43633 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP2AO43633 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP2AO43633 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms