Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF3O43395 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF3O43395 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRPF3O43395 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms