Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTSS1O43312 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTSS1O43312 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms