Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TO15178 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TO15178 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TO15178 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TO15178 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TO15178 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TO15178 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TO15178 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TO15178 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TO15178 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TO15178 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TO15178 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TO15178 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TO15178 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TO15178 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TO15178 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TO15178 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TO15178 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TO15178 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TO15178 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TO15178 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TO15178 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TO15178 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TO15178 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TO15178 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TO15178 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TO15178 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TO15178 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TO15178 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TO15178 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TO15178 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TO15178 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TO15178 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TO15178 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TO15178 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TO15178 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TO15178 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TO15178 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TO15178 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TO15178 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TO15178 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TO15178 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TO15178 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TO15178 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TO15178 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TO15178 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TO15178 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TO15178 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TO15178 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms