Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP3O14828 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAMP3O14828 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP3O14828 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP3O14828 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms