Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A3R1O14745 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3R1O14745 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC9A3R1O14745 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3R1O14745 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms