Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM38O00635 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM38O00635 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM38O00635 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM38O00635 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms