Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PODXLO00592 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PODXLO00592 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PODXLO00592 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PODXLO00592 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PODXLO00592 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PODXLO00592 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PODXLO00592 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PODXLO00592 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PODXLO00592 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PODXLO00592 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PODXLO00592 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PODXLO00592 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PODXLO00592 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PODXLO00592 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PODXLO00592 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PODXLO00592 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PODXLO00592 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PODXLO00592 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PODXLO00592 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PODXLO00592 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PODXLO00592 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PODXLO00592 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PODXLO00592 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PODXLO00592 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXLO00592 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXLO00592 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXLO00592 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PODXLO00592 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXLO00592 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXLO00592 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PODXLO00592 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXLO00592 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXLO00592 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXLO00592 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXLO00592 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PODXLO00592 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PODXLO00592 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXLO00592 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXLO00592 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXLO00592 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXLO00592 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXLO00592 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXLO00592 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PODXLO00592 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PODXLO00592 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXLO00592 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PODXLO00592 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PODXLO00592 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXLO00592 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXLO00592 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXLO00592 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXLO00592 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXLO00592 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PODXLO00592 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PODXLO00592 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXLO00592 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PODXLO00592 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXLO00592 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXLO00592 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXLO00592 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXLO00592 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PODXLO00592 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXLO00592 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXLO00592 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PODXLO00592 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms