Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PIK3CDO00329 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3CDO00329 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3CDO00329 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3CDO00329 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3CDO00329 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms