Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RFXAPO00287 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RFXAPO00287 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RFXAPO00287 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RFXAPO00287 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RFXAPO00287 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms