Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLRC4-KLRK1H3BQV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms