Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf98E9PRG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf98E9PRG8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C11orf98E9PRG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf98E9PRG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms