Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHISA9B4DS77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHISA9B4DS77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHISA9B4DS77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SHISA9B4DS77 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms