Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A6NNZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A6NNZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A6NNZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A6NNZ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A6NNZ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNZ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNZ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNZ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNZ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNZ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A6NNZ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A6NNZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A6NNZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A6NNZ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A6NNZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A6NNZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
A6NNZ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A6NNZ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A6NNZ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A6NNZ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
A6NNZ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A6NNZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A6NNZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A6NNZ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A6NNZ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A6NNZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A6NNZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A6NNZ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A6NNZ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NNZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NNZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NNZ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NNZ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NNZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NNZ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A6NNZ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NNZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NNZ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NNZ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NNZ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NNZ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A6NNZ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NNZ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NNZ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NNZ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NNZ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NNZ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A6NNZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A6NNZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A6NNZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A6NNZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A6NNZ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NNZ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NNZ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NNZ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A6NNZ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A6NNZ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A6NNZ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A6NNZ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A6NNZ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A6NNZ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A6NNZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A6NNZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A6NNZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A6NNZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A6NNZ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A6NNZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A6NNZ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
A6NNZ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
A6NNZ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A6NNZ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A6NNZ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A6NNZ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A6NNZ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms