Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00862A6NCI5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00862A6NCI5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00862A6NCI5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms