Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPED1A4D0V7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPED1A4D0V7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPED1A4D0V7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms