Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC78A2IDD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC78A2IDD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms