Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN11A1L157 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN11A1L157 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN11A1L157 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN11A1L157 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms