Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLRN2A0PK11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CLRN2A0PK11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLRN2A0PK11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLRN2A0PK11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms