Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1W2PQD3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms